MTG CLM unterstützt die gängigen PKI-Automatisierungsprotokolle ACME, EST, CMP und SCEP sowie eine umfangreiche REST API. Zusätzlich steht der MTG ERS CLI Client für Skripting und automatisierte Abläufe zur Verfügung.
Über REST API und CLI lässt sich MTG CLM außerdem in Infrastructure-as-Code- und Automatisierungswerkzeuge wie Ansible und Terraform sowie in CI/CD-Prozesse integrieren.